De Rekenkamer Oost-Nederland kent een collegiaal bestuur bestaande uit drie leden waaronder de voorzitter. De leden worden door Provinciale Staten van Gelderland en Overijssel voorgedragen en benoemd voor een termijn van zes jaar. Het bestuur van de Rekenkamer Oost-Nederland wordt ondersteund door een bureau.
drs. M.M.S. (Michael) Mekel
voorzitter
De heer drs. M.M.S. (Michael) Mekel is sinds 1 januari 2014 voorzitter van de Rekenkamer Oost-Nederland. Naast zijn voorzitterschap is hij strategisch raadsadviseur bij de Raad voor het Openbaar Bestuur.
ir. T.J.A. (Edo) Gies
bestuurslid
De heer ir. T.J.A. (Edo) Gies is sinds 1 januari 2016 bestuurslid bij de Rekenkamer Oost-Nederland. Naast bestuurslid is hij adviseur en onderzoeker bij Wageningen Environmental Research (WENR). Ook is hij lid van de Rekenkamer Waterschap Rivierenland (WSRL) en De Stichtse Rijnlanden (HDSR).
drs. S.C. (Saskia) van der Haagen
bestuurslid
Mevrouw drs. S.C. (Saskia) van der Haagen is sinds 1 juni 2019 bestuurslid bij de Rekenkamer Oost-Nederland. Daarnaast is zij Directeur Concernzaken bij de provincie Noord-Holland.